Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBBP07437 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBBP07437 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBBP07437 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBBP07437 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBBP07437 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBBP07437 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TUBBP07437 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBBP07437 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBBP07437 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBBP07437 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBBP07437 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBBP07437 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBBP07437 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBBP07437 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBBP07437 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBBP07437 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBBP07437 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBBP07437 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBBP07437 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBBP07437 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBBP07437 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBBP07437 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBBP07437 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBBP07437 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBBP07437 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBBP07437 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBBP07437 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBBP07437 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBBP07437 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TUBBP07437 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUBBP07437 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBBP07437 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBBP07437 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUBBP07437 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBBP07437 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBBP07437 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBBP07437 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBBP07437 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBBP07437 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBBP07437 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBBP07437 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBBP07437 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBBP07437 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBBP07437 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBBP07437 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBBP07437 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBBP07437 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBBP07437 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBBP07437 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBBP07437 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBBP07437 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBBP07437 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBBP07437 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBBP07437 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBBP07437 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBBP07437 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBBP07437 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUBBP07437 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBBP07437 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBBP07437 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBBP07437 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBBP07437 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBBP07437 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBBP07437 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBBP07437 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBBP07437 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBBP07437 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBBP07437 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBBP07437 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBBP07437 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBBP07437 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBBP07437 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBBP07437 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBBP07437 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBBP07437 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBBP07437 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBBP07437 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBBP07437 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBBP07437 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBBP07437 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBBP07437 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBBP07437 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBBP07437 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBBP07437 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBBP07437 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBBP07437 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBBP07437 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBBP07437 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBBP07437 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBBP07437 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBBP07437 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBBP07437 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBBP07437 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBBP07437 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBBP07437 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBBP07437 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBBP07437 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBBP07437 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBBP07437 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms