Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8BP07358 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8BP07358 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8BP07358 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8BP07358 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8BP07358 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C8BP07358 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C8BP07358 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
C8BP07358 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8BP07358 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8BP07358 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8BP07358 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8BP07358 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8BP07358 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8BP07358 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8BP07358 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8BP07358 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8BP07358 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8BP07358 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8BP07358 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8BP07358 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8BP07358 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8BP07358 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8BP07358 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8BP07358 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8BP07358 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8BP07358 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8BP07358 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8BP07358 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8BP07358 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8BP07358 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8BP07358 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C8BP07358 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C8BP07358 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8BP07358 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8BP07358 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8BP07358 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8BP07358 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8BP07358 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8BP07358 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8BP07358 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C8BP07358 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C8BP07358 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C8BP07358 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C8BP07358 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C8BP07358 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C8BP07358 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C8BP07358 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C8BP07358 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C8BP07358 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8BP07358 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8BP07358 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8BP07358 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8BP07358 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8BP07358 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8BP07358 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C8BP07358 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8BP07358 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8BP07358 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C8BP07358 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8BP07358 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C8BP07358 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C8BP07358 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C8BP07358 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C8BP07358 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C8BP07358 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C8BP07358 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8BP07358 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8BP07358 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8BP07358 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8BP07358 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C8BP07358 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8BP07358 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8BP07358 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8BP07358 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8BP07358 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8BP07358 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8BP07358 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8BP07358 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C8BP07358 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C8BP07358 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8BP07358 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8BP07358 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8BP07358 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8BP07358 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8BP07358 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8BP07358 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8BP07358 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8BP07358 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C8BP07358 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8BP07358 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8BP07358 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C8BP07358 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C8BP07358 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C8BP07358 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8BP07358 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8BP07358 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8BP07358 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8BP07358 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8BP07358 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms