Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TtrP07309 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtrP07309 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtrP07309 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtrP07309 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtrP07309 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtrP07309 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtrP07309 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtrP07309 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtrP07309 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtrP07309 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtrP07309 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtrP07309 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtrP07309 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtrP07309 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtrP07309 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtrP07309 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtrP07309 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtrP07309 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtrP07309 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtrP07309 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtrP07309 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtrP07309 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtrP07309 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtrP07309 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtrP07309 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtrP07309 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtrP07309 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtrP07309 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtrP07309 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtrP07309 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtrP07309 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtrP07309 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TtrP07309 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtrP07309 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtrP07309 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtrP07309 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtrP07309 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtrP07309 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TtrP07309 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtrP07309 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtrP07309 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtrP07309 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtrP07309 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TtrP07309 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtrP07309 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtrP07309 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtrP07309 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TtrP07309 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtrP07309 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtrP07309 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtrP07309 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TtrP07309 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtrP07309 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtrP07309 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtrP07309 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtrP07309 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtrP07309 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtrP07309 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtrP07309 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TtrP07309 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtrP07309 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtrP07309 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtrP07309 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtrP07309 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtrP07309 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtrP07309 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TtrP07309 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtrP07309 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtrP07309 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtrP07309 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TtrP07309 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TtrP07309 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtrP07309 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtrP07309 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TtrP07309 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtrP07309 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtrP07309 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtrP07309 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtrP07309 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtrP07309 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TtrP07309 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtrP07309 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtrP07309 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtrP07309 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtrP07309 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtrP07309 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtrP07309 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtrP07309 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TtrP07309 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtrP07309 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtrP07309 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtrP07309 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtrP07309 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtrP07309 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TtrP07309 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtrP07309 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtrP07309 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TtrP07309 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtrP07309 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms