Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SparcP07214 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SparcP07214 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SparcP07214 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SparcP07214 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SparcP07214 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SparcP07214 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SparcP07214 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SparcP07214 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SparcP07214 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SparcP07214 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SparcP07214 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SparcP07214 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SparcP07214 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SparcP07214 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SparcP07214 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SparcP07214 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SparcP07214 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SparcP07214 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SparcP07214 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SparcP07214 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SparcP07214 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SparcP07214 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SparcP07214 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SparcP07214 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SparcP07214 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SparcP07214 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SparcP07214 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SparcP07214 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SparcP07214 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SparcP07214 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SparcP07214 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SparcP07214 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SparcP07214 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SparcP07214 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SparcP07214 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SparcP07214 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SparcP07214 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SparcP07214 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SparcP07214 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SparcP07214 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SparcP07214 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SparcP07214 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SparcP07214 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SparcP07214 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SparcP07214 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SparcP07214 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SparcP07214 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SparcP07214 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SparcP07214 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SparcP07214 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SparcP07214 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SparcP07214 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SparcP07214 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SparcP07214 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SparcP07214 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SparcP07214 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SparcP07214 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SparcP07214 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SparcP07214 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SparcP07214 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SparcP07214 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SparcP07214 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SparcP07214 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SparcP07214 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SparcP07214 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SparcP07214 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SparcP07214 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SparcP07214 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SparcP07214 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SparcP07214 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SparcP07214 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SparcP07214 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SparcP07214 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SparcP07214 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SparcP07214 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SparcP07214 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SparcP07214 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SparcP07214 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SparcP07214 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SparcP07214 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SparcP07214 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SparcP07214 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SparcP07214 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SparcP07214 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SparcP07214 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SparcP07214 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SparcP07214 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SparcP07214 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SparcP07214 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SparcP07214 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SparcP07214 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SparcP07214 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SparcP07214 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SparcP07214 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SparcP07214 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SparcP07214 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SparcP07214 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SparcP07214 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SparcP07214 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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