Protein–RNA interactions for Protein: P07205

PGK2, Phosphoglycerate kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGK2P07205 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PGK2P07205 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PGK2P07205 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PGK2P07205 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PGK2P07205 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PGK2P07205 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PGK2P07205 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PGK2P07205 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PGK2P07205 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PGK2P07205 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PGK2P07205 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PGK2P07205 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PGK2P07205 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PGK2P07205 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PGK2P07205 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PGK2P07205 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PGK2P07205 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PGK2P07205 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PGK2P07205 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PGK2P07205 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PGK2P07205 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PGK2P07205 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PGK2P07205 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PGK2P07205 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PGK2P07205 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PGK2P07205 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PGK2P07205 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PGK2P07205 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PGK2P07205 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PGK2P07205 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PGK2P07205 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PGK2P07205 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PGK2P07205 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PGK2P07205 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PGK2P07205 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PGK2P07205 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PGK2P07205 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PGK2P07205 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PGK2P07205 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PGK2P07205 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PGK2P07205 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PGK2P07205 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PGK2P07205 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGK2P07205 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGK2P07205 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGK2P07205 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGK2P07205 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGK2P07205 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PGK2P07205 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PGK2P07205 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PGK2P07205 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PGK2P07205 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PGK2P07205 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PGK2P07205 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PGK2P07205 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PGK2P07205 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PGK2P07205 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PGK2P07205 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PGK2P07205 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PGK2P07205 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PGK2P07205 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PGK2P07205 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PGK2P07205 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PGK2P07205 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PGK2P07205 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PGK2P07205 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PGK2P07205 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PGK2P07205 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PGK2P07205 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PGK2P07205 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PGK2P07205 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PGK2P07205 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PGK2P07205 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PGK2P07205 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PGK2P07205 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PGK2P07205 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PGK2P07205 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PGK2P07205 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PGK2P07205 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PGK2P07205 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PGK2P07205 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PGK2P07205 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PGK2P07205 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PGK2P07205 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PGK2P07205 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PGK2P07205 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PGK2P07205 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PGK2P07205 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PGK2P07205 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PGK2P07205 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PGK2P07205 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PGK2P07205 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PGK2P07205 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PGK2P07205 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PGK2P07205 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PGK2P07205 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PGK2P07205 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PGK2P07205 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PGK2P07205 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PGK2P07205 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1655.2 ms