Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Me1P06801 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Me1P06801 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Me1P06801 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Me1P06801 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Me1P06801 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Me1P06801 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Me1P06801 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Me1P06801 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Me1P06801 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Me1P06801 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Me1P06801 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Me1P06801 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Me1P06801 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Me1P06801 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Me1P06801 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Me1P06801 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Me1P06801 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Me1P06801 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Me1P06801 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Me1P06801 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Me1P06801 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Me1P06801 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Me1P06801 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Me1P06801 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Me1P06801 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Me1P06801 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Me1P06801 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Me1P06801 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Me1P06801 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Me1P06801 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Me1P06801 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Me1P06801 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Me1P06801 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Me1P06801 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Me1P06801 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Me1P06801 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Me1P06801 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Me1P06801 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Me1P06801 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Me1P06801 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Me1P06801 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Me1P06801 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Me1P06801 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Me1P06801 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Me1P06801 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Me1P06801 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Me1P06801 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Me1P06801 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Me1P06801 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Me1P06801 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Me1P06801 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Me1P06801 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Me1P06801 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Me1P06801 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Me1P06801 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Me1P06801 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Me1P06801 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Me1P06801 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Me1P06801 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Me1P06801 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Me1P06801 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Me1P06801 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Me1P06801 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Me1P06801 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Me1P06801 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Me1P06801 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Me1P06801 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Me1P06801 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Me1P06801 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Me1P06801 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Me1P06801 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Me1P06801 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Me1P06801 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Me1P06801 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Me1P06801 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Me1P06801 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Me1P06801 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Me1P06801 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Me1P06801 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Me1P06801 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Me1P06801 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Me1P06801 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Me1P06801 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Me1P06801 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Me1P06801 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Me1P06801 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Me1P06801 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Me1P06801 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Me1P06801 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Me1P06801 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Me1P06801 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Me1P06801 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Me1P06801 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Me1P06801 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Me1P06801 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Me1P06801 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Me1P06801 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Me1P06801 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Me1P06801 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms