Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGAVP06756 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAVP06756 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGAVP06756 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGAVP06756 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGAVP06756 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms