Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA4P06727 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA4P06727 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOA4P06727 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOA4P06727 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOA4P06727 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOA4P06727 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOA4P06727 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOA4P06727 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOA4P06727 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOA4P06727 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOA4P06727 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA4P06727 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA4P06727 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA4P06727 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA4P06727 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA4P06727 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA4P06727 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA4P06727 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA4P06727 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
APOA4P06727 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA4P06727 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA4P06727 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA4P06727 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA4P06727 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA4P06727 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA4P06727 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA4P06727 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA4P06727 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA4P06727 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA4P06727 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA4P06727 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA4P06727 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA4P06727 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA4P06727 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA4P06727 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA4P06727 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APOA4P06727 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOA4P06727 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA4P06727 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA4P06727 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA4P06727 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOA4P06727 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA4P06727 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA4P06727 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA4P06727 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA4P06727 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOA4P06727 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA4P06727 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA4P06727 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA4P06727 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA4P06727 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA4P06727 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA4P06727 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA4P06727 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA4P06727 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA4P06727 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA4P06727 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA4P06727 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA4P06727 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA4P06727 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA4P06727 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA4P06727 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA4P06727 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA4P06727 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA4P06727 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA4P06727 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA4P06727 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA4P06727 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA4P06727 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA4P06727 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA4P06727 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA4P06727 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA4P06727 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA4P06727 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA4P06727 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA4P06727 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA4P06727 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA4P06727 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA4P06727 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA4P06727 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA4P06727 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA4P06727 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA4P06727 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA4P06727 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA4P06727 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA4P06727 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA4P06727 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA4P06727 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA4P06727 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA4P06727 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOA4P06727 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA4P06727 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA4P06727 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA4P06727 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA4P06727 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA4P06727 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA4P06727 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA4P06727 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA4P06727 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms