Protein–RNA interactions for Protein: P05784

Krt18, Keratin, type I cytoskeletal 18, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt18P05784 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt18P05784 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt18P05784 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt18P05784 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt18P05784 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt18P05784 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt18P05784 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt18P05784 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt18P05784 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt18P05784 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt18P05784 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt18P05784 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt18P05784 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt18P05784 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt18P05784 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt18P05784 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt18P05784 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt18P05784 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt18P05784 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt18P05784 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt18P05784 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt18P05784 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt18P05784 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms