Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCCBP05166 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCCBP05166 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCCBP05166 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCCBP05166 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCCBP05166 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCCBP05166 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCCBP05166 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCCBP05166 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCBP05166 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCBP05166 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCBP05166 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCCBP05166 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCBP05166 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCBP05166 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCBP05166 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCBP05166 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCBP05166 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCCBP05166 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCCBP05166 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCCBP05166 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCCBP05166 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCBP05166 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCBP05166 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCBP05166 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCCBP05166 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCBP05166 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCBP05166 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCBP05166 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCBP05166 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCBP05166 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCBP05166 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCCBP05166 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCBP05166 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCBP05166 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCBP05166 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCCBP05166 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCBP05166 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCBP05166 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCBP05166 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCBP05166 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCBP05166 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCCBP05166 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCBP05166 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCBP05166 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCBP05166 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCBP05166 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCCBP05166 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCBP05166 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCBP05166 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCBP05166 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCBP05166 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCCBP05166 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCBP05166 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCBP05166 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCBP05166 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCBP05166 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCCBP05166 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCBP05166 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCBP05166 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCCBP05166 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCBP05166 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCBP05166 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCCBP05166 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCCBP05166 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCCBP05166 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCCBP05166 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCCBP05166 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCCBP05166 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCCBP05166 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCCBP05166 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCCBP05166 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCCBP05166 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCCBP05166 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PCCBP05166 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCCBP05166 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCCBP05166 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCCBP05166 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCCBP05166 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCCBP05166 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCCBP05166 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCCBP05166 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCCBP05166 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCCBP05166 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCCBP05166 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCCBP05166 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCCBP05166 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCCBP05166 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCCBP05166 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCCBP05166 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCCBP05166 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCCBP05166 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCCBP05166 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCCBP05166 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCCBP05166 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCCBP05166 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCCBP05166 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCCBP05166 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCCBP05166 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCCBP05166 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms