Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB2P05107 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB2P05107 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGB2P05107 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB2P05107 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms