Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1P04632 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1P04632 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1P04632 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1P04632 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms