Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRB1P04280 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRB1P04280 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRB1P04280 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRB1P04280 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRB1P04280 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRB1P04280 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRB1P04280 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRB1P04280 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRB1P04280 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRB1P04280 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRB1P04280 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRB1P04280 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRB1P04280 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRB1P04280 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRB1P04280 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRB1P04280 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRB1P04280 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRB1P04280 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRB1P04280 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRB1P04280 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRB1P04280 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRB1P04280 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRB1P04280 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRB1P04280 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRB1P04280 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRB1P04280 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRB1P04280 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRB1P04280 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRB1P04280 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRB1P04280 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRB1P04280 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRB1P04280 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRB1P04280 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRB1P04280 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRB1P04280 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRB1P04280 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRB1P04280 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRB1P04280 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRB1P04280 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRB1P04280 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRB1P04280 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRB1P04280 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRB1P04280 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRB1P04280 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRB1P04280 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRB1P04280 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRB1P04280 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRB1P04280 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRB1P04280 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRB1P04280 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRB1P04280 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRB1P04280 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRB1P04280 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRB1P04280 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRB1P04280 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRB1P04280 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRB1P04280 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRB1P04280 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRB1P04280 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRB1P04280 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRB1P04280 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRB1P04280 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRB1P04280 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRB1P04280 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRB1P04280 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRB1P04280 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRB1P04280 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRB1P04280 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PRB1P04280 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRB1P04280 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRB1P04280 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRB1P04280 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRB1P04280 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRB1P04280 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRB1P04280 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRB1P04280 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRB1P04280 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRB1P04280 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRB1P04280 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRB1P04280 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRB1P04280 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRB1P04280 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRB1P04280 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRB1P04280 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRB1P04280 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRB1P04280 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRB1P04280 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRB1P04280 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRB1P04280 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRB1P04280 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRB1P04280 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRB1P04280 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRB1P04280 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRB1P04280 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRB1P04280 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRB1P04280 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRB1P04280 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRB1P04280 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRB1P04280 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms