Protein–RNA interactions for Protein: P04234

CD3D, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3DP04234 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD3DP04234 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD3DP04234 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD3DP04234 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD3DP04234 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD3DP04234 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD3DP04234 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD3DP04234 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD3DP04234 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD3DP04234 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD3DP04234 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD3DP04234 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD3DP04234 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD3DP04234 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD3DP04234 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD3DP04234 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD3DP04234 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD3DP04234 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD3DP04234 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD3DP04234 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD3DP04234 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD3DP04234 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD3DP04234 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD3DP04234 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD3DP04234 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD3DP04234 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD3DP04234 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD3DP04234 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD3DP04234 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD3DP04234 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD3DP04234 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD3DP04234 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD3DP04234 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD3DP04234 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD3DP04234 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD3DP04234 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD3DP04234 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD3DP04234 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD3DP04234 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD3DP04234 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CD3DP04234 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD3DP04234 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD3DP04234 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD3DP04234 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD3DP04234 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD3DP04234 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD3DP04234 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD3DP04234 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD3DP04234 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD3DP04234 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD3DP04234 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD3DP04234 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD3DP04234 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD3DP04234 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD3DP04234 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD3DP04234 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD3DP04234 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD3DP04234 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD3DP04234 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD3DP04234 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD3DP04234 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD3DP04234 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD3DP04234 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD3DP04234 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD3DP04234 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD3DP04234 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD3DP04234 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD3DP04234 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD3DP04234 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD3DP04234 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD3DP04234 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD3DP04234 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD3DP04234 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD3DP04234 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD3DP04234 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD3DP04234 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD3DP04234 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD3DP04234 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD3DP04234 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD3DP04234 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD3DP04234 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD3DP04234 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD3DP04234 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD3DP04234 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD3DP04234 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CD3DP04234 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD3DP04234 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD3DP04234 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD3DP04234 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD3DP04234 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD3DP04234 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD3DP04234 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD3DP04234 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD3DP04234 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD3DP04234 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CD3DP04234 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD3DP04234 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD3DP04234 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD3DP04234 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD3DP04234 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms