Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A1P02730 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A1P02730 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC4A1P02730 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms