Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01755 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01755 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01755 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01755 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01755 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01755 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01755 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01755 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01755 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01755 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01755 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01755 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01755 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01755 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01755 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01755 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01755 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01755 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01755 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01755 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01755 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01755 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01755 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01755 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01755 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01755 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01755 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01755 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01755 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01755 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01755 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01755 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01755 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01755 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01755 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01755 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01755 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01755 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01755 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01755 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01755 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01755 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01755 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01755 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01755 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01755 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01755 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01755 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01755 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01755 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01755 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01755 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01755 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01755 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms