Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POMCP01189 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POMCP01189 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POMCP01189 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POMCP01189 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POMCP01189 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POMCP01189 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POMCP01189 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POMCP01189 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POMCP01189 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POMCP01189 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POMCP01189 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POMCP01189 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.56■■■□□ 2
POMCP01189 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POMCP01189 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
POMCP01189 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POMCP01189 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POMCP01189 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POMCP01189 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
POMCP01189 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POMCP01189 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POMCP01189 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POMCP01189 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POMCP01189 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POMCP01189 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
POMCP01189 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.52■■■□□ 2
POMCP01189 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POMCP01189 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POMCP01189 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POMCP01189 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POMCP01189 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POMCP01189 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POMCP01189 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POMCP01189 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POMCP01189 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POMCP01189 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POMCP01189 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
POMCP01189 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POMCP01189 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POMCP01189 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POMCP01189 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POMCP01189 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POMCP01189 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POMCP01189 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POMCP01189 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POMCP01189 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POMCP01189 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POMCP01189 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POMCP01189 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POMCP01189 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POMCP01189 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POMCP01189 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POMCP01189 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POMCP01189 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POMCP01189 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POMCP01189 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POMCP01189 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POMCP01189 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POMCP01189 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POMCP01189 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POMCP01189 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POMCP01189 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POMCP01189 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POMCP01189 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POMCP01189 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POMCP01189 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POMCP01189 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POMCP01189 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POMCP01189 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POMCP01189 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POMCP01189 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POMCP01189 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POMCP01189 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POMCP01189 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POMCP01189 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POMCP01189 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POMCP01189 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POMCP01189 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POMCP01189 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POMCP01189 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POMCP01189 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POMCP01189 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POMCP01189 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POMCP01189 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POMCP01189 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POMCP01189 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POMCP01189 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
POMCP01189 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POMCP01189 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POMCP01189 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POMCP01189 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POMCP01189 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POMCP01189 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POMCP01189 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POMCP01189 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POMCP01189 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POMCP01189 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POMCP01189 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POMCP01189 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POMCP01189 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms