Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SERPINC1P01008 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SERPINC1P01008 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SERPINC1P01008 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SERPINC1P01008 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms