Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
APBA3O96018 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
APBA3O96018 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
APBA3O96018 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
APBA3O96018 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
APBA3O96018 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
APBA3O96018 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
APBA3O96018 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
APBA3O96018 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
APBA3O96018 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
APBA3O96018 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
APBA3O96018 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
APBA3O96018 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
APBA3O96018 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
APBA3O96018 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
APBA3O96018 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
APBA3O96018 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
APBA3O96018 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
APBA3O96018 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
APBA3O96018 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
APBA3O96018 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
APBA3O96018 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
APBA3O96018 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
APBA3O96018 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
APBA3O96018 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
APBA3O96018 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
APBA3O96018 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
APBA3O96018 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
APBA3O96018 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
APBA3O96018 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
APBA3O96018 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
APBA3O96018 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
APBA3O96018 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
APBA3O96018 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
APBA3O96018 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
APBA3O96018 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
APBA3O96018 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
APBA3O96018 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
APBA3O96018 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
APBA3O96018 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
APBA3O96018 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
APBA3O96018 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
APBA3O96018 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
APBA3O96018 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
APBA3O96018 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
APBA3O96018 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
APBA3O96018 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
APBA3O96018 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
APBA3O96018 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
APBA3O96018 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
APBA3O96018 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
APBA3O96018 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
APBA3O96018 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
APBA3O96018 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
APBA3O96018 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
APBA3O96018 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
APBA3O96018 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
APBA3O96018 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
APBA3O96018 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
APBA3O96018 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
APBA3O96018 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
APBA3O96018 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
APBA3O96018 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
APBA3O96018 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
APBA3O96018 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
APBA3O96018 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
APBA3O96018 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
APBA3O96018 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
APBA3O96018 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
APBA3O96018 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
APBA3O96018 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
APBA3O96018 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
APBA3O96018 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
APBA3O96018 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
APBA3O96018 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
APBA3O96018 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
APBA3O96018 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
APBA3O96018 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
APBA3O96018 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
APBA3O96018 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
APBA3O96018 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
APBA3O96018 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
APBA3O96018 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
APBA3O96018 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
APBA3O96018 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
APBA3O96018 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
APBA3O96018 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
APBA3O96018 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
APBA3O96018 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
APBA3O96018 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
APBA3O96018 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
APBA3O96018 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
APBA3O96018 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
APBA3O96018 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
APBA3O96018 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
APBA3O96018 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
APBA3O96018 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
APBA3O96018 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
APBA3O96018 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
APBA3O96018 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms