Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBB3O95704 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBB3O95704 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBB3O95704 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APBB3O95704 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBB3O95704 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBB3O95704 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBB3O95704 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APBB3O95704 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APBB3O95704 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBB3O95704 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBB3O95704 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APBB3O95704 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APBB3O95704 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBB3O95704 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APBB3O95704 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBB3O95704 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBB3O95704 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APBB3O95704 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APBB3O95704 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APBB3O95704 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBB3O95704 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APBB3O95704 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBB3O95704 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBB3O95704 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBB3O95704 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
APBB3O95704 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBB3O95704 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBB3O95704 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APBB3O95704 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBB3O95704 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBB3O95704 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APBB3O95704 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APBB3O95704 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APBB3O95704 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
APBB3O95704 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APBB3O95704 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBB3O95704 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBB3O95704 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBB3O95704 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APBB3O95704 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APBB3O95704 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APBB3O95704 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APBB3O95704 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APBB3O95704 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APBB3O95704 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
APBB3O95704 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
APBB3O95704 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APBB3O95704 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APBB3O95704 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APBB3O95704 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APBB3O95704 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APBB3O95704 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
APBB3O95704 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APBB3O95704 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APBB3O95704 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APBB3O95704 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
APBB3O95704 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APBB3O95704 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APBB3O95704 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APBB3O95704 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APBB3O95704 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APBB3O95704 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APBB3O95704 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APBB3O95704 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APBB3O95704 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APBB3O95704 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APBB3O95704 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APBB3O95704 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APBB3O95704 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APBB3O95704 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APBB3O95704 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APBB3O95704 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APBB3O95704 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
APBB3O95704 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APBB3O95704 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APBB3O95704 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APBB3O95704 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APBB3O95704 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APBB3O95704 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APBB3O95704 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APBB3O95704 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APBB3O95704 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APBB3O95704 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APBB3O95704 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APBB3O95704 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APBB3O95704 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APBB3O95704 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APBB3O95704 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APBB3O95704 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APBB3O95704 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APBB3O95704 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APBB3O95704 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APBB3O95704 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APBB3O95704 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APBB3O95704 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APBB3O95704 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APBB3O95704 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APBB3O95704 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APBB3O95704 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms