Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZIC2O95409 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIC2O95409 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIC2O95409 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms