Protein–RNA interactions for Protein: O95405

ZFYVE9, Zinc finger FYVE domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE9O95405 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZFYVE9O95405 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ZFYVE9O95405 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ZFYVE9O95405 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ZFYVE9O95405 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ZFYVE9O95405 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZFYVE9O95405 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZFYVE9O95405 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ZFYVE9O95405 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ZFYVE9O95405 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ZFYVE9O95405 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ZFYVE9O95405 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ZFYVE9O95405 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ZFYVE9O95405 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ZFYVE9O95405 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ZFYVE9O95405 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ZFYVE9O95405 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ZFYVE9O95405 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ZFYVE9O95405 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ZFYVE9O95405 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ZFYVE9O95405 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ZFYVE9O95405 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
ZFYVE9O95405 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ZFYVE9O95405 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
ZFYVE9O95405 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ZFYVE9O95405 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ZFYVE9O95405 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ZFYVE9O95405 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ZFYVE9O95405 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ZFYVE9O95405 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms