Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF4AO95239 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KIF4AO95239 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIF4AO95239 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF4AO95239 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIF4AO95239 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms