Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LETM1O95202 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LETM1O95202 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LETM1O95202 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LETM1O95202 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LETM1O95202 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LETM1O95202 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LETM1O95202 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LETM1O95202 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LETM1O95202 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LETM1O95202 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
LETM1O95202 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LETM1O95202 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LETM1O95202 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LETM1O95202 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LETM1O95202 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LETM1O95202 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LETM1O95202 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LETM1O95202 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LETM1O95202 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LETM1O95202 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LETM1O95202 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LETM1O95202 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LETM1O95202 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LETM1O95202 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LETM1O95202 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LETM1O95202 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LETM1O95202 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LETM1O95202 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LETM1O95202 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LETM1O95202 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LETM1O95202 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LETM1O95202 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LETM1O95202 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LETM1O95202 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LETM1O95202 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LETM1O95202 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LETM1O95202 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LETM1O95202 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LETM1O95202 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LETM1O95202 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LETM1O95202 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LETM1O95202 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LETM1O95202 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LETM1O95202 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LETM1O95202 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LETM1O95202 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LETM1O95202 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LETM1O95202 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LETM1O95202 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LETM1O95202 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LETM1O95202 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LETM1O95202 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LETM1O95202 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LETM1O95202 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LETM1O95202 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LETM1O95202 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LETM1O95202 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LETM1O95202 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LETM1O95202 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LETM1O95202 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LETM1O95202 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LETM1O95202 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LETM1O95202 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LETM1O95202 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LETM1O95202 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LETM1O95202 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LETM1O95202 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LETM1O95202 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LETM1O95202 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LETM1O95202 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LETM1O95202 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LETM1O95202 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LETM1O95202 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LETM1O95202 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LETM1O95202 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LETM1O95202 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LETM1O95202 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LETM1O95202 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LETM1O95202 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LETM1O95202 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LETM1O95202 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LETM1O95202 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LETM1O95202 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LETM1O95202 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LETM1O95202 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LETM1O95202 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LETM1O95202 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LETM1O95202 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LETM1O95202 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LETM1O95202 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LETM1O95202 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LETM1O95202 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LETM1O95202 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LETM1O95202 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LETM1O95202 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LETM1O95202 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LETM1O95202 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LETM1O95202 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LETM1O95202 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms