Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM63AO94886 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM63AO94886 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM63AO94886 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM63AO94886 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM63AO94886 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1040.6 ms