Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnnt1O88346 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tnnt1O88346 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tnnt1O88346 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tnnt1O88346 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tnnt1O88346 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnnt1O88346 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnnt1O88346 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnnt1O88346 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnnt1O88346 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnnt1O88346 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnnt1O88346 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnnt1O88346 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Tnnt1O88346 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnnt1O88346 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnnt1O88346 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnnt1O88346 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnnt1O88346 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnnt1O88346 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnnt1O88346 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt1O88346 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tnnt1O88346 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tnnt1O88346 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Tnnt1O88346 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms