Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cfdp1O88271 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cfdp1O88271 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cfdp1O88271 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cfdp1O88271 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cfdp1O88271 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cfdp1O88271 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cfdp1O88271 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cfdp1O88271 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cfdp1O88271 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cfdp1O88271 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cfdp1O88271 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cfdp1O88271 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cfdp1O88271 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cfdp1O88271 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Cfdp1O88271 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms