Protein–RNA interactions for Protein: O75973

C1QL1, C1q-related factor, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL1O75973 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QL1O75973 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1QL1O75973 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1QL1O75973 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QL1O75973 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms