Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCM2O75603 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCM2O75603 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GCM2O75603 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCM2O75603 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCM2O75603 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GCM2O75603 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCM2O75603 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCM2O75603 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCM2O75603 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCM2O75603 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCM2O75603 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCM2O75603 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCM2O75603 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCM2O75603 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCM2O75603 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCM2O75603 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCM2O75603 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCM2O75603 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCM2O75603 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCM2O75603 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCM2O75603 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GCM2O75603 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCM2O75603 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCM2O75603 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCM2O75603 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCM2O75603 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCM2O75603 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCM2O75603 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCM2O75603 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCM2O75603 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCM2O75603 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCM2O75603 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GCM2O75603 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCM2O75603 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCM2O75603 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCM2O75603 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCM2O75603 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCM2O75603 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCM2O75603 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCM2O75603 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCM2O75603 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCM2O75603 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCM2O75603 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCM2O75603 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCM2O75603 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCM2O75603 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCM2O75603 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCM2O75603 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCM2O75603 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCM2O75603 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCM2O75603 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCM2O75603 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCM2O75603 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCM2O75603 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCM2O75603 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCM2O75603 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCM2O75603 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCM2O75603 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCM2O75603 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCM2O75603 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCM2O75603 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCM2O75603 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCM2O75603 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCM2O75603 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCM2O75603 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCM2O75603 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCM2O75603 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GCM2O75603 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCM2O75603 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCM2O75603 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GCM2O75603 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCM2O75603 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCM2O75603 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCM2O75603 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCM2O75603 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCM2O75603 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCM2O75603 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCM2O75603 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GCM2O75603 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCM2O75603 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCM2O75603 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCM2O75603 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCM2O75603 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GCM2O75603 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCM2O75603 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCM2O75603 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCM2O75603 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCM2O75603 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GCM2O75603 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GCM2O75603 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCM2O75603 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GCM2O75603 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCM2O75603 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCM2O75603 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCM2O75603 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCM2O75603 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCM2O75603 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCM2O75603 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCM2O75603 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms