Protein–RNA interactions for Protein: O75592

MYCBP2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, humanhuman

Predictions only

Length 4,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBP2O75592 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYCBP2O75592 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBP2O75592 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MYCBP2O75592 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms