Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC4O75487 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC4O75487 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC4O75487 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC4O75487 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC4O75487 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC4O75487 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC4O75487 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC4O75487 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC4O75487 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC4O75487 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC4O75487 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC4O75487 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC4O75487 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPC4O75487 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC4O75487 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC4O75487 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC4O75487 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC4O75487 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC4O75487 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC4O75487 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC4O75487 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC4O75487 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC4O75487 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC4O75487 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC4O75487 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC4O75487 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC4O75487 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC4O75487 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC4O75487 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC4O75487 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC4O75487 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC4O75487 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC4O75487 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC4O75487 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC4O75487 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC4O75487 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC4O75487 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC4O75487 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPC4O75487 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC4O75487 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC4O75487 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC4O75487 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPC4O75487 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC4O75487 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC4O75487 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC4O75487 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC4O75487 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC4O75487 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC4O75487 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC4O75487 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC4O75487 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC4O75487 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC4O75487 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC4O75487 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC4O75487 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC4O75487 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC4O75487 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC4O75487 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC4O75487 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC4O75487 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC4O75487 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC4O75487 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC4O75487 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC4O75487 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPC4O75487 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPC4O75487 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPC4O75487 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC4O75487 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC4O75487 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC4O75487 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC4O75487 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC4O75487 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC4O75487 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC4O75487 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC4O75487 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC4O75487 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC4O75487 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC4O75487 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC4O75487 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC4O75487 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC4O75487 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC4O75487 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC4O75487 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC4O75487 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC4O75487 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC4O75487 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC4O75487 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC4O75487 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC4O75487 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC4O75487 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC4O75487 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC4O75487 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC4O75487 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC4O75487 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC4O75487 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC4O75487 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC4O75487 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC4O75487 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC4O75487 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms