Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LGR5O75473 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LGR5O75473 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LGR5O75473 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LGR5O75473 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LGR5O75473 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LGR5O75473 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LGR5O75473 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LGR5O75473 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LGR5O75473 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LGR5O75473 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LGR5O75473 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LGR5O75473 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LGR5O75473 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LGR5O75473 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LGR5O75473 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LGR5O75473 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LGR5O75473 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LGR5O75473 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LGR5O75473 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LGR5O75473 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LGR5O75473 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LGR5O75473 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LGR5O75473 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LGR5O75473 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LGR5O75473 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LGR5O75473 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LGR5O75473 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LGR5O75473 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LGR5O75473 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LGR5O75473 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LGR5O75473 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LGR5O75473 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LGR5O75473 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LGR5O75473 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LGR5O75473 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LGR5O75473 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LGR5O75473 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LGR5O75473 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LGR5O75473 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LGR5O75473 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LGR5O75473 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LGR5O75473 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LGR5O75473 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LGR5O75473 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LGR5O75473 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LGR5O75473 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LGR5O75473 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LGR5O75473 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LGR5O75473 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LGR5O75473 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LGR5O75473 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LGR5O75473 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LGR5O75473 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LGR5O75473 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LGR5O75473 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR5O75473 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR5O75473 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR5O75473 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LGR5O75473 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LGR5O75473 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LGR5O75473 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LGR5O75473 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LGR5O75473 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR5O75473 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR5O75473 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR5O75473 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR5O75473 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR5O75473 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR5O75473 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LGR5O75473 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LGR5O75473 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LGR5O75473 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LGR5O75473 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LGR5O75473 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LGR5O75473 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LGR5O75473 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LGR5O75473 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LGR5O75473 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR5O75473 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR5O75473 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR5O75473 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR5O75473 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LGR5O75473 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LGR5O75473 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LGR5O75473 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LGR5O75473 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LGR5O75473 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LGR5O75473 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LGR5O75473 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LGR5O75473 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LGR5O75473 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LGR5O75473 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LGR5O75473 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LGR5O75473 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LGR5O75473 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LGR5O75473 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LGR5O75473 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LGR5O75473 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LGR5O75473 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms