Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH16O75309 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH16O75309 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH16O75309 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH16O75309 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH16O75309 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH16O75309 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH16O75309 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH16O75309 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH16O75309 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH16O75309 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH16O75309 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH16O75309 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH16O75309 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH16O75309 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH16O75309 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH16O75309 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH16O75309 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH16O75309 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH16O75309 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH16O75309 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH16O75309 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH16O75309 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH16O75309 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH16O75309 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH16O75309 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH16O75309 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH16O75309 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH16O75309 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH16O75309 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH16O75309 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH16O75309 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH16O75309 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH16O75309 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH16O75309 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH16O75309 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH16O75309 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH16O75309 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH16O75309 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH16O75309 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH16O75309 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDH16O75309 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH16O75309 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH16O75309 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH16O75309 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH16O75309 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH16O75309 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH16O75309 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH16O75309 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH16O75309 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH16O75309 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH16O75309 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH16O75309 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH16O75309 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH16O75309 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH16O75309 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH16O75309 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH16O75309 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH16O75309 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH16O75309 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH16O75309 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH16O75309 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH16O75309 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH16O75309 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH16O75309 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH16O75309 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH16O75309 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH16O75309 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH16O75309 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH16O75309 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDH16O75309 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDH16O75309 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH16O75309 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH16O75309 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH16O75309 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH16O75309 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH16O75309 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH16O75309 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH16O75309 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH16O75309 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH16O75309 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH16O75309 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH16O75309 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH16O75309 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH16O75309 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH16O75309 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH16O75309 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH16O75309 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH16O75309 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH16O75309 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH16O75309 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH16O75309 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH16O75309 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH16O75309 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH16O75309 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH16O75309 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDH16O75309 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH16O75309 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH16O75309 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH16O75309 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms