Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM24O75264 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMIM24O75264 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms