Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP4O75096 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP4O75096 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP4O75096 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP4O75096 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP4O75096 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP4O75096 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP4O75096 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP4O75096 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP4O75096 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP4O75096 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP4O75096 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP4O75096 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP4O75096 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP4O75096 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP4O75096 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP4O75096 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP4O75096 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP4O75096 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRP4O75096 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP4O75096 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP4O75096 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP4O75096 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP4O75096 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRP4O75096 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP4O75096 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP4O75096 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP4O75096 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP4O75096 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP4O75096 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP4O75096 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP4O75096 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP4O75096 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP4O75096 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP4O75096 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP4O75096 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP4O75096 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP4O75096 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP4O75096 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP4O75096 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP4O75096 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP4O75096 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP4O75096 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRP4O75096 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRP4O75096 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP4O75096 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP4O75096 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP4O75096 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP4O75096 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP4O75096 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP4O75096 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP4O75096 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP4O75096 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRP4O75096 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRP4O75096 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRP4O75096 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRP4O75096 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRP4O75096 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRP4O75096 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRP4O75096 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRP4O75096 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRP4O75096 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRP4O75096 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRP4O75096 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRP4O75096 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRP4O75096 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRP4O75096 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRP4O75096 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRP4O75096 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRP4O75096 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRP4O75096 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRP4O75096 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRP4O75096 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRP4O75096 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRP4O75096 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRP4O75096 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRP4O75096 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRP4O75096 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRP4O75096 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRP4O75096 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRP4O75096 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRP4O75096 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRP4O75096 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP4O75096 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP4O75096 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP4O75096 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP4O75096 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP4O75096 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRP4O75096 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP4O75096 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP4O75096 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP4O75096 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP4O75096 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRP4O75096 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP4O75096 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP4O75096 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRP4O75096 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRP4O75096 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP4O75096 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP4O75096 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms