Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan6O70401 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan6O70401 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan6O70401 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan6O70401 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan6O70401 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan6O70401 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan6O70401 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan6O70401 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan6O70401 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tspan6O70401 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan6O70401 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tspan6O70401 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan6O70401 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan6O70401 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan6O70401 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tspan6O70401 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tspan6O70401 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tspan6O70401 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan6O70401 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms