Protein–RNA interactions for Protein: O70172

Pip4k2a, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2aO70172 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pip4k2aO70172 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pip4k2aO70172 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pip4k2aO70172 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pip4k2aO70172 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pip4k2aO70172 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pip4k2aO70172 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pip4k2aO70172 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pip4k2aO70172 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pip4k2aO70172 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pip4k2aO70172 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pip4k2aO70172 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pip4k2aO70172 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pip4k2aO70172 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pip4k2aO70172 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms