Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DTNBO60941 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DTNBO60941 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DTNBO60941 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DTNBO60941 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DTNBO60941 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DTNBO60941 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DTNBO60941 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DTNBO60941 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
DTNBO60941 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
DTNBO60941 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DTNBO60941 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DTNBO60941 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DTNBO60941 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
DTNBO60941 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DTNBO60941 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
DTNBO60941 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DTNBO60941 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DTNBO60941 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DTNBO60941 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DTNBO60941 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DTNBO60941 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DTNBO60941 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DTNBO60941 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DTNBO60941 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DTNBO60941 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DTNBO60941 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DTNBO60941 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DTNBO60941 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DTNBO60941 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DTNBO60941 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DTNBO60941 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DTNBO60941 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DTNBO60941 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DTNBO60941 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DTNBO60941 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DTNBO60941 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DTNBO60941 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
DTNBO60941 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
DTNBO60941 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DTNBO60941 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DTNBO60941 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DTNBO60941 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DTNBO60941 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
DTNBO60941 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DTNBO60941 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DTNBO60941 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DTNBO60941 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DTNBO60941 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DTNBO60941 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DTNBO60941 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DTNBO60941 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DTNBO60941 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DTNBO60941 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DTNBO60941 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DTNBO60941 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DTNBO60941 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DTNBO60941 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DTNBO60941 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DTNBO60941 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DTNBO60941 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DTNBO60941 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DTNBO60941 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DTNBO60941 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DTNBO60941 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
DTNBO60941 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DTNBO60941 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DTNBO60941 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DTNBO60941 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DTNBO60941 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DTNBO60941 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DTNBO60941 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DTNBO60941 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DTNBO60941 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DTNBO60941 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DTNBO60941 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DTNBO60941 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DTNBO60941 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DTNBO60941 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DTNBO60941 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DTNBO60941 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DTNBO60941 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
DTNBO60941 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DTNBO60941 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DTNBO60941 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DTNBO60941 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DTNBO60941 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DTNBO60941 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DTNBO60941 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DTNBO60941 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DTNBO60941 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DTNBO60941 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DTNBO60941 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DTNBO60941 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DTNBO60941 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DTNBO60941 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DTNBO60941 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DTNBO60941 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DTNBO60941 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DTNBO60941 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms