Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8B3O60423 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8B3O60423 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP8B3O60423 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP8B3O60423 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms