Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5O60239 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5O60239 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5O60239 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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