Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Supt5hO55201 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Supt5hO55201 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Supt5hO55201 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Supt5hO55201 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Supt5hO55201 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Supt5hO55201 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Supt5hO55201 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Supt5hO55201 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Supt5hO55201 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Supt5hO55201 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Supt5hO55201 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Supt5hO55201 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Supt5hO55201 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Supt5hO55201 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Supt5hO55201 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Supt5hO55201 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Supt5hO55201 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Supt5hO55201 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Supt5hO55201 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Supt5hO55201 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Supt5hO55201 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Supt5hO55201 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Supt5hO55201 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC33.14■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Supt5hO55201 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Supt5hO55201 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms