Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr2O55101 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syngr2O55101 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syngr2O55101 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syngr2O55101 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms