Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SlkO54988 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SlkO54988 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SlkO54988 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SlkO54988 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SlkO54988 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SlkO54988 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SlkO54988 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SlkO54988 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SlkO54988 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SlkO54988 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SlkO54988 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SlkO54988 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SlkO54988 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SlkO54988 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SlkO54988 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SlkO54988 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SlkO54988 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SlkO54988 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SlkO54988 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SlkO54988 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SlkO54988 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SlkO54988 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SlkO54988 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SlkO54988 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SlkO54988 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SlkO54988 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SlkO54988 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SlkO54988 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SlkO54988 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SlkO54988 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SlkO54988 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SlkO54988 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SlkO54988 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SlkO54988 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SlkO54988 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SlkO54988 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SlkO54988 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SlkO54988 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SlkO54988 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SlkO54988 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SlkO54988 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SlkO54988 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SlkO54988 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SlkO54988 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SlkO54988 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SlkO54988 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SlkO54988 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SlkO54988 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SlkO54988 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SlkO54988 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SlkO54988 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SlkO54988 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SlkO54988 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SlkO54988 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SlkO54988 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SlkO54988 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SlkO54988 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SlkO54988 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SlkO54988 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SlkO54988 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SlkO54988 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SlkO54988 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SlkO54988 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SlkO54988 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SlkO54988 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SlkO54988 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SlkO54988 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SlkO54988 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SlkO54988 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SlkO54988 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SlkO54988 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SlkO54988 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SlkO54988 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SlkO54988 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SlkO54988 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SlkO54988 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SlkO54988 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SlkO54988 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SlkO54988 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SlkO54988 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SlkO54988 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SlkO54988 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SlkO54988 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SlkO54988 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SlkO54988 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SlkO54988 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SlkO54988 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SlkO54988 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SlkO54988 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SlkO54988 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SlkO54988 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SlkO54988 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SlkO54988 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SlkO54988 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SlkO54988 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SlkO54988 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SlkO54988 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SlkO54988 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SlkO54988 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms