Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarce1O54941 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Smarce1O54941 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarce1O54941 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarce1O54941 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarce1O54941 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarce1O54941 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarce1O54941 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarce1O54941 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarce1O54941 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarce1O54941 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarce1O54941 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarce1O54941 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarce1O54941 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarce1O54941 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarce1O54941 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarce1O54941 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarce1O54941 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarce1O54941 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarce1O54941 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms