Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2f6O54917 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2f6O54917 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2f6O54917 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f6O54917 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f6O54917 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2f6O54917 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2f6O54917 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2f6O54917 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2f6O54917 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f6O54917 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f6O54917 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f6O54917 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2f6O54917 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E2f6O54917 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f6O54917 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f6O54917 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f6O54917 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f6O54917 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f6O54917 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f6O54917 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f6O54917 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f6O54917 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms