Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cavin1O54724 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cavin1O54724 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cavin1O54724 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cavin1O54724 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms