Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EdaO54693 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EdaO54693 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EdaO54693 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EdaO54693 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EdaO54693 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EdaO54693 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EdaO54693 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EdaO54693 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EdaO54693 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EdaO54693 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EdaO54693 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EdaO54693 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EdaO54693 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EdaO54693 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EdaO54693 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EdaO54693 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EdaO54693 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EdaO54693 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EdaO54693 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EdaO54693 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EdaO54693 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EdaO54693 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EdaO54693 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EdaO54693 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EdaO54693 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EdaO54693 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EdaO54693 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EdaO54693 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EdaO54693 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EdaO54693 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EdaO54693 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EdaO54693 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EdaO54693 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EdaO54693 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EdaO54693 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EdaO54693 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EdaO54693 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EdaO54693 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EdaO54693 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EdaO54693 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EdaO54693 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EdaO54693 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EdaO54693 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EdaO54693 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EdaO54693 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EdaO54693 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EdaO54693 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EdaO54693 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EdaO54693 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EdaO54693 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EdaO54693 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EdaO54693 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EdaO54693 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EdaO54693 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EdaO54693 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EdaO54693 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EdaO54693 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EdaO54693 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EdaO54693 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EdaO54693 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EdaO54693 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EdaO54693 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EdaO54693 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EdaO54693 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EdaO54693 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EdaO54693 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EdaO54693 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EdaO54693 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EdaO54693 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EdaO54693 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EdaO54693 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EdaO54693 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EdaO54693 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EdaO54693 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EdaO54693 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EdaO54693 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EdaO54693 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EdaO54693 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EdaO54693 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EdaO54693 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EdaO54693 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EdaO54693 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EdaO54693 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EdaO54693 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EdaO54693 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EdaO54693 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EdaO54693 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EdaO54693 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EdaO54693 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EdaO54693 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EdaO54693 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EdaO54693 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EdaO54693 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EdaO54693 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EdaO54693 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EdaO54693 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EdaO54693 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EdaO54693 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EdaO54693 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms