Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUDT21O43809 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUDT21O43809 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUDT21O43809 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUDT21O43809 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDT21O43809 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms