Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENRO43583 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENRO43583 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENRO43583 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENRO43583 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENRO43583 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENRO43583 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENRO43583 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENRO43583 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENRO43583 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENRO43583 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENRO43583 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENRO43583 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENRO43583 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENRO43583 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENRO43583 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENRO43583 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENRO43583 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENRO43583 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
DENRO43583 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DENRO43583 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DENRO43583 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DENRO43583 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENRO43583 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENRO43583 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENRO43583 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENRO43583 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENRO43583 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENRO43583 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENRO43583 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENRO43583 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENRO43583 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENRO43583 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENRO43583 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENRO43583 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENRO43583 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENRO43583 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENRO43583 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENRO43583 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENRO43583 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENRO43583 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENRO43583 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENRO43583 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DENRO43583 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENRO43583 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENRO43583 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENRO43583 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENRO43583 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENRO43583 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENRO43583 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENRO43583 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENRO43583 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENRO43583 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENRO43583 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENRO43583 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENRO43583 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENRO43583 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DENRO43583 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENRO43583 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DENRO43583 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DENRO43583 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DENRO43583 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENRO43583 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENRO43583 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENRO43583 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENRO43583 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENRO43583 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENRO43583 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENRO43583 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENRO43583 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENRO43583 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENRO43583 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENRO43583 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENRO43583 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENRO43583 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENRO43583 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENRO43583 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENRO43583 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENRO43583 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENRO43583 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENRO43583 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENRO43583 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENRO43583 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENRO43583 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENRO43583 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENRO43583 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENRO43583 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENRO43583 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENRO43583 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENRO43583 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENRO43583 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENRO43583 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENRO43583 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENRO43583 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENRO43583 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENRO43583 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENRO43583 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DENRO43583 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENRO43583 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENRO43583 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms