Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD6O43541 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD6O43541 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD6O43541 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms